鉢の底に少し用土（荒木田土や市販の水生植物用用土など）を入れて棒などで突いて固めます。元肥として固形の肥料を2～3個入れます。用土を鉢の半分ほど入れて、その上に睡蓮の株を植えて、芽が土から少し出るように調整して用土をされに加えて、棒でつつき固めてください。植え付けの後一か月程度は、鉢底の表面から水面までの深さを10センチ程度、姫スイレンの場合は2～3センチ程度に保ってください。一か月後からは、大輪系で10～15センチ程度、姫スイレンで5～7センチ程度で管理して下さい。深すぎると株元の水温が上昇せずに花付きが悪くなります。日の良く当たる場所でのかんりが最適です。日当たりの悪い場所では花付きが悪くなりますので注意が必要です。